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| 物理研究所 | 电子电气与通信工程学院 | 福建物质结构研究所 | 城市环境研究所 |
| 高能物理研究所 | 中丹学院 | 山东省 | |
| 声学研究所 | 华大教育中心 | 海洋研究所 | 烟台海岸带研究所 |
| 理论物理研究所 | 科技管理学院 | 青岛生物能源与过程研究所 | |
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| 渗流流体力学研究所 | 植物研究所 | 武汉岩土力学研究所 | 武汉植物园 |
| 自然科学史研究所 | 生物物理研究所 | 武汉物理与数学研究所 | 水生生物研究所 |
| 理化技术研究所 | 微生物研究所 | 测量与地球物理研究所 | 武汉病毒研究所 |
| 化学研究所 | 遗传与发育生物学研究所 | 湖南省 | |
| 过程工程研究所 | 心理研究所 | 亚热带农业生态研究所 | |
| 生态环境研究中心 | 计算技术研究所 | 广东省 | |
| 古脊椎动物与古人类研究所 | 工程热物理研究所 | 广州化学研究所 | 广州地球化学研究所 |
| 大气物理研究所 | 半导体研究所 | 南海海洋研究所 | 广州生物医药与健康研究院 |
| 地理科学与资源研究所 | 电子学研究所 | 华南植物园 | 深圳先进技术研究院 |
| 遥感与数字地球研究所 | 自动化研究所 | 广州能源研究所 | |
| 空间科学与应用研究中心 | 电工研究所 | 重庆市 | |
| 地质与地球物理研究所 | 软件研究所 | 重庆绿色智能技术研究院 | |
| 数学科学学院 | 国家科学图书馆 | 四川省 | |
| 物理学院 | 微电子研究所 | 成都有机化学研究所 | 光电技术研究所 |
| 化学与化工学院 | 计算机网络信息中心 | 成都山地灾害与环境研究所 | 成都计算机应用研究所 |
| 地球科学学院 | 科技政策与管理科学研究所 | 成都生物研究所 | |
| 资源与环境学院 | 北京基因组研究所 | 贵州省 | |
| 生命科学学院 | 青藏高原研究所 | 地球化学研究所 | |
| 计算机与控制学院 | 光电研究院 | 云南省 | |
| 管理学院 | 国家纳米科学中心 | 云南天文台 | 昆明植物研究所 |
| 人文学院 | 信息工程研究所 | 昆明动物研究所 | 西双版纳热带植物园 |
| 外语系 | 空间应用工程与技术中心 | 陕西省 | |
| 天津地区 | 国家授时中心 | 西安光学精密机械研究所 | |
| 天津工业生物技术研究所 | 水土保持与生态环境研究中心 | 地球环境研究所 | |
| 河北省 | 甘肃省 | ||
| 遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心 | 近代物理研究所 | 兰州地质研究所 | |
| 山西省 | 兰州化学物理研究所 | 寒区旱区环境与工程研究所 | |
| 山西煤炭化学研究所 | 青海省 | ||
| 辽宁省 | 青海盐湖研究所 | 西北高原生物研究所 | |
| 大连化学物理研究所 | 沈阳应用生态研究所 | 新疆维吾尔族自治区 | |
| 沈阳计算技术研究所 | 沈阳自动化研究所 | 新疆理化技术研究所 | 新疆天文台 |
| 金属研究所 | 新疆生态与地理研究所 | ||
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| 声学研究所东海研究站 | 上海光学精密机械研究所 | 宁波材料技术与工程研究所 | |
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